Benchware Muse 2.1 藥物設計 英文版
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軟體名稱: Benchware Muse 2.1 
語系版本: 英文版 
光碟片數: 單片裝 
保護種類: 授權檔 
破解說明: 見最底下 
系統支援: 適用 32 與 64 位元版的 Windows XP/Vista/7 
硬體需求: PC 
軟體類型: 藥物設計 
更新日期: 2011.12.29 
軟體發行: Benchware(L.z0) 
官方網站: http://tripos.com/index.php?family=modules,SimplePage,,,&page=Muse 
中文網站: 無 
軟體簡介: (以官方網站為準) 
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Muse  是專為加快先導候選藥物識別與最佳化而設計的一個全新藥物設計工作流。 
利用 MUSE，CADD 科研工作者以及藥物化學工作者可以進行滿足特定設計指標的全 
新結構、骨架、或側鏈的識別。適用於先導化合物的替換、骨架替換或在固定母核 
周圍產生新的R-基團。生成滿足多重設計指標的新穎類藥化合物。易於與公司內部 
或第三方打分方法整合用做為設計指標。 
 
特點 
 
◆對於藥物化學工作者、臨時需要模型製作的研究人員以及專業的計算化學工作者 
  來說很直覺式、並且易於使用 
◆設計與先導化合物結構在形狀與藥效團特徵上一致的新穎候選藥物 
◆通過MUSE與其它打分工具(例如對接、ADME預測等)的整合，生成以多重設計指標 
  為基礎的新穎類藥化合物 
◆豐富、完整的化學結構突變算子，確保類藥結構的產生 
◆決不產生化學上無效的結構，具有化學反應性或不希望的基團的結構會被自動濾 
  除 
◆在設計期間，可以自主選定需要保留的母核或者R-基團 
 
原理介紹 
 
MUSE解決了藥物發現科學工作者每天都要面對的問題： 
 
◆應該怎麼才能產生滿足多種不同設計指標的類藥化合物呢？ 
◆當搜尋完現有化合物庫、一籌莫展的時候，該怎麼辦呢？ 
◆如果對虛擬篩選的結果進行過濾後發現沒有什麼東西可以滿足你設計目標的時候 
  ，該怎麼做呢？ 
 
MUSE是一個全新藥物設計工作流，其使得使用者可以解決有機化學上的問題直至獲 
得更多新穎的類藥化合物。MUSE內建了基於配體的打分函數，對於一組先導化合物 
，可以對其最佳化得到與之在形狀與藥效團性質上類似的新穎類藥化合物。 
 
成功的藥物設計候選物應該考慮到：靶點的藥效、靶點的選擇性、良好的ADME性質 
、毒性等。MUSE允許生成這樣的新穎類藥化合物，其可以滿足多重藥物設計的參數 
 
有了MUSE，你還可以將其它的計算性質整合進來，並利用這些來最佳化設計新的類 
藥化合物。這些性質可以是用公司內部的或第三方的打分函數 (比如血腦屏障透過 
率、ADME性質、毒性、對接等等...)來生成，這樣你就可以輕而易舉地產生滿足多 
重設計指標的新穎類藥化合物。 
 
MUSE是用分子進化方法來生成一代一代的分子。從你自己感興趣的、或者MUSE提供 
給的一組結構出發，用28種進化分子算子將父代結構突變為子代結構。 
 
MUSE的進化算子生成新穎類藥化合物，在選中這些分子之前，先用最佳化的設計指 
標對這些分子打分。多次連續地循環操作，改善了每代生成的分子。 
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站長安裝測試環境與安裝說明: 
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‧測試環境 Windows 7 SP1 ６４位元繁體中文版、Intel Core 2 Duo CPU E7400 
  2.80 GHz、1 GB 記憶體、NTFS 格式 80.0Gb 硬碟。 
 
‧見光碟 "安裝說明.txt" 中文說明 
 

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